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    芯片常見問題分析

    發(fā)布時間: 2010-06-30  點擊次數(shù): 1578次

    1 芯片實驗和定量PCR的優(yōu)劣比較?
      基因表達譜芯片實驗可以對大量基因一次性進行定量研究,定量PCR則對大量基因需逐一進行定量研究。
    2 在芯片制作過程中的PCR原液是否可以為客戶保存?
      可以抽干冷凍保存一年。
    3 可否用DNA和芯片雜交?
      不可以,因為芯片上的樣品是cDNA而真核基因DNA中普遍存在內(nèi)顯子,核酸雜交無法順利進行。
    4 對于臨床癥狀不明顯的的遺傳病,如何取樣?
      可以從病人抽取血樣或者骨髓。
    5 如何保存血樣?
      將血樣中血細(xì)胞分離出來,然后-80℃低溫保存。
    6 脫落細(xì)胞是否都是死亡的細(xì)胞, 其中是否可以抽提mRNA?
      不*是死亡的細(xì)胞, 但是mRNA的含量比較少, 建議用正常細(xì)胞抽提mRNA。
    7 完成一張芯片的實驗,需要的細(xì)胞的量是多少?
      需要5×106的細(xì)胞量
    8 提供的電泳圖和OD值如何評價mRNA的質(zhì)量?
      電泳圖可以分析mRNA和總RNA是否降解, OD值可以判斷純度。
    9 是否可以將同一癥狀的病例混合后抽提,看共性表達?
      可以。

    10 芯片是否可以重復(fù)使用?
      不可以。
    11 雜交后的芯片如何保存?
      避光常溫保存幾個星期。
    12 在實驗前期,如何定參照物?
      根據(jù)實驗設(shè)計來確定使用共同參照物還是各自的參照物。
    13 如何消除基因芯片實驗中的個體差異?
      可以使用同一樣品重復(fù)芯片實驗,取其共性,獲得可靠的數(shù)據(jù)結(jié)果。
    14 芯片在雜交過程中為什么會發(fā)生非特異性雜交, 如何降低?
      這是由于DNA堿基錯配造成, 提高芯片雜交后洗脫液的溫度可以降低非特異性雜交。
    15 芯片上基因cDNA是從什么組織中取得的?
      芯片上基因cDNA來源于美國I.M.A.G.E.項目,是從人的各種組織中分離確定的,并且每個基因cDNA具有明確功能定義的,與其它基因不相重復(fù)的。

    16 芯片上有多少條有效基因?
      目前芯片上的有效基因數(shù)目zui多有7500條,每條基因都有明確的功能定義,不相重復(fù)。
    17 基因表達譜芯片是如何進行分類的?
      基因表達譜芯片是根據(jù)芯片的用途來分類的,每種芯片上包括與特定用途相關(guān)的基因。
    18表達譜芯片是否可以按照器官來進行分類?
      不可以。
    19 基因芯片的假陽性率是多少?
      一般控制在1%---2%。
    20 芯片制作中如何控制芯片的質(zhì)量
      控制芯片的質(zhì)量主要要以下幾個方面, 玻片的選擇, 點樣的規(guī)范, 固定率, 芯片的背景,有效的避免融點等。
    21 實驗結(jié)果中的熒光信號散點圖有何意義?
      可以-直觀反映雜交后的差異表達與正常表達的比率, 顯示相關(guān)度和實驗結(jié)果的好壞。
    21 掃描背景不清楚會對實驗結(jié)果產(chǎn)生什么影響?
      會導(dǎo)致實驗結(jié)果混亂,而導(dǎo)致實驗失敗, 如果是雜質(zhì)污染等原因造成,可以通過洗片解決, 如果是mRNA不純,則需要重新抽提。
    22 實驗失敗有幾種原因?
      mRNA的降解, MRNA的純度差, 反轉(zhuǎn)錄酶失敗, 標(biāo)記效率低, CY3容易見光降解。
    23 得到實驗的結(jié)果后, 可以進行那些研究的工作?
      可以通過基因的差異表達, 尋找目標(biāo)基因, 進行聚類分析, 對差異基因進行進一步的功能研究。

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